Behnisch Architekten fue fundada en 1989 como sucursal del estudio de Günter Behnisch, Behnisch & Partner. El "Stadtbüro", como se llamaba a esta sucursal, se desarrolló bajo la dirección de Stefan Behnisch y en 1991 se convirtió en una firma completamente independiente, con su propia estructura de asociación y operaciones. Günter Behnisch continuó dirigiendo su práctica, Behnisch & Partner, en paralelo hasta su jubilación y el cierre de la firma en 2005. La oficina de Stefan desarrolló un perfil distintivamente internacional, buscando proyectos en toda Europa y eventualmente también en América del Norte, donde la dedicación de la firma a los principios de construcción sostenible junto con un agudo sentido de la experiencia humana en arquitectura encontró audiencia.

En 2005, el Stadtbüro independiente adoptó el nombre actual, Behnisch Architekten. Desde entonces, la firma se ha convertido en una exitosa práctica internacional con sedes en Stuttgart (desde 1991), Los Ángeles (desde 1999), Boston (desde 2006), Múnich (desde 2009) y Weimar (desde 2022).